Meester namorou o ator Sebastian Stan com quem atuou na sรฉrie Gossip Girl por dois anos (2008-2010).
No inรญcio de 2013, Meester iniciou um romance com o ator Adam Brody, com quem contracenou em The Oranges, o casal ficou noivo em novembro de 2013, e casou-se em fevereiro de 2014, em uma cerimรดnia realizada no Mรฉxico.
O casal tem uma filha, Arlo Day Brody, nascida em 4 de agosto de 2015 e um filho nascido no ano de 2020.
